Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem260Q8BMD6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms