Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4bQ8BGE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4bQ8BGE6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms