Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms