Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms