Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amigo1Q80ZD8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms