Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms