Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NischQ80TM9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NischQ80TM9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
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