Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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