Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmQ7TSN2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms