Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms