Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp397Q7TNK4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp397Q7TNK4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms