Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd3Q7TM95 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms