Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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