Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Msrb2Q78J03 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msrb2Q78J03 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msrb2Q78J03 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms