Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms