Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms