Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Topbp1Q6ZQF0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Topbp1Q6ZQF0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms