Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms