Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5C6

Gm10277, Predicted gene 10277, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10277Q6R5C6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10277Q6R5C6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10277Q6R5C6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm10277Q6R5C6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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