Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms