Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf4Q6PFF0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scaf4Q6PFF0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms