Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vstm2lQ6PDS0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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