Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms