Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms