Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms