Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RgmaQ6PCX7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms