Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpbp1l1Q6NZP2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms