Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asic1Q6NXK8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asic1Q6NXK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms