Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frem2Q6NVD0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms