Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd11Q6NS46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcd11Q6NS46 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms