Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt42Q6IFX2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms