Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms