Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hecw2Q6I6G8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.8 ms