Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop58Q6DFW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop58Q6DFW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms