Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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Pdzrn3Q69ZS0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdzrn3Q69ZS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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