Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pkp4Q68FH0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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