Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kiaa1549Q68FD9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kiaa1549Q68FD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms