Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4fQ66X05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms