Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VclQ64727 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VclQ64727 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VclQ64727 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VclQ64727 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VclQ64727 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VclQ64727 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VclQ64727 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VclQ64727 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VclQ64727 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VclQ64727 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VclQ64727 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VclQ64727 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms