Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim24Q64127 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim24Q64127 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim24Q64127 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim24Q64127 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms