Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptp4a1Q63739 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms