Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift52Q62559 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ift52Q62559 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms