Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tpd52Q62393 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tpd52Q62393 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms