Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrhQ62361 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TrhQ62361 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TrhQ62361 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrhQ62361 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrhQ62361 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms