Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spock1Q62288 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms