Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SypQ62277 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SypQ62277 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SypQ62277 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SypQ62277 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SypQ62277 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SypQ62277 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SypQ62277 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SypQ62277 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SypQ62277 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms