Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh1a2Q62148 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh1a2Q62148 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms