Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Npm1Q61937 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Npm1Q61937 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms