Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg2Q61878 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms