Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itm2aQ61500 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itm2aQ61500 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms